微生物菌劑的肥效持續(xù)時間長，可以減少化肥的施用量，本身無毒無害。大量的化肥和殺蟲劑使土壤受到不同程度的污染，并產(chǎn)生一定的毒性。生長在受污染土壤中的作物不僅會造成生長障礙，還會對人體造成危害。消除土壤污染是環(huán)境治理的重要內(nèi)容。

鹽堿地的共性是有機質(zhì)含量低，土壤物理和化學性質(zhì)差，陰陽離子對作物生長有害，土壤肥力低，作物不易促進幼苗。鹽堿地不容易發(fā)育幼苗，施肥的一般原則是增加復合微生物肥料和生物有機肥的施用，適當控制化肥的施用?；蕬嗍┯糜袡C質(zhì)含量高的生物有機肥，減少化肥的施用量，化肥盡量不接近種子，以免增加土壤溶液的濃度，影響發(fā)芽。根據(jù)情況進行追肥，以避免過量。在條件允許的情況下，可以使用大量的秸稈還田，種植耐鹽堿綠色肥料，以減少鹽堿對作物的危害。

粘土地一般含有有機物，無機膠體較多，土壤肥料保護能力強，養(yǎng)分不易流失。然而，粘土的肥料供應緩慢，施肥后效果緩慢。這種土壤老幼苗不是小幼苗，肥料效果緩慢而生長，土壤緊，滲透性差，作物根困難。這種土壤采用復合微生物肥料和生物有機肥，通過豐富的有機質(zhì)和有益微生物活性，提高滲透性，提高肥料和水分保護能力。這種土壤性質(zhì)為陰，如少量未成熟的馬糞與復合微生物肥料和生物有機肥，效果更好。

砂土地應增加生物有機肥，提高土壤有機質(zhì)含量，提高肥料保護能力。由于砂土通風良好，土壤溫暖，有機質(zhì)易分解，施用未完全分解的有機肥受影響小于粘土地面。條件允許的地區(qū)可以種植貧瘠的綠色肥料，以改善土壤的物理和化學特性。

當微生物菌劑被應用到土壤中時，有益的微生物在土壤中迅速繁殖，產(chǎn)生各種對作物有益的代謝物。這些代謝物可以刺激或調(diào)節(jié)作物的生長，使作物強壯，達到增加產(chǎn)量的目的。它不僅為作物生長提供了所需的NPK和中微量元素，而且還為作物提供了有機質(zhì)和有益的微生物活性細菌。此外，微生物菌劑中的一些細菌還可以分泌一些刺激性的維生素來刺激作物的生長，使作物強壯，改善營養(yǎng)狀況。